怎么设计目标植物的引物(怎么设计目标植物的引物方案)
2在框中粘贴入你的原始序列要比你要扩的目的片段两端延伸一点3在框的下方有许多可以设定的限制条件,如片段长度,一定包含的片段位置,引物长度,引物退火温度等,你可以进行设定 4点击quotpickup primersquot就会出现下一页。
5 避免二聚体和自身互补设计引物时需要避免两个引物之间形成二聚体或自身互补,这会影响PCR效率和特异性6 进行特异性检测使用软件工具进行特异性检测,以确保所选引物只扩增目标DNA序列而不扩增其他非特异性DNA7。
这个问题比较复杂,你可以说一下你的具体实验目的设计的方法一般用特定的引物设计软件,我用过的最方便直观的是SnapGene免费版的一般就够用的,一般用的比较多的是Primer Premier60之类的可以去网上找操作指导嗯。
引物设计需要注意的地方很多,在大多数情况下,我们都是在知道已知模板序列时进行PCR扩增的设计的目的是在两个目标间取得平衡扩增特异性和扩增效率引物分析软件将试图通过使用每一引物设计变化的预定值在这两个目标间取得。
挑取你所需要的物种的序列,尽量多点,然后下下来,用DNAMAN或别的生物学分析工具进行比对,会比对出保守区序列,选取保守区序列进行引物设计,先扩增出这段序列,然后进行延伸,进行全基因扩增。
当然可以,您的这两种植物亲缘关系部是很远,没问题的我们常说的同源克隆都利用的是这个原理,但设计引物的时候需要注意,建议设计兼并引物成功可能性会高一点。